南沙湾未来将打造成粤港澳大湾区创新合作先行区、粤港澳大湾区海上门户、广州国际海洋文体休闲中心。
通过将南沙湾的山、海、城等特点梳理与运用，形成三个各具特点的中心。北边和整个南沙区以及广州中心区有交通上的便捷，再结合现有的资源和环境，形成一个海洋文化休闲为主体的海上客厅节点；在中部，结合邮轮母港以及连接港澳的客运港，形成一个游憩商务区，体现南沙湾作为广州出海口门户的职能和风采；而南边，是早已形成气候的以粤港合作、文教创新园区为主体的湾区中部科技创新区。这三个小中心在空间上是各有侧重来体现其定位，但并非完全割裂的，这三点其实是渗透到湾区的每一片区，只是空间的侧重点不同。
